Wohl auch wegen der fast immer selbstlimitierenden Natur der Erkrankung wird in der hausärztlichen Routine oft auf eine mikrobiologische Labordiagnostik verzichtet.
Eine mikrobiologische Untersuchung von Stuhlproben auf Gastroenteritiserreger sollte aber jedenfalls bei blutiger Diarrhö, bei gehäuftem Auftreten (Ausbrüche) sowie bei hospitalisierten Patienten veranlasst werden.
Campylobacter jejuni/coli, Clostridium difficile und dem Norovirus als Erreger akuter Gastroenteritiden kommt derzeit die hauptsächliche Bedeutung zu.
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